Falls DB:
Erstelle eine tabelle mit ner id beginnend bei 0.

PHP:
Verbindung zur DB, aktuelle ID auslesen und in Variable speichern ($i).
$neuerDateiname = $UPLOAD_PFAD."/".$name.$i; einfügen und das alte ersetzen.
$i um eins hochzählen ($i++).
Neue id in DB schreiben.

Falls keine DB:
Das ganze inne Textdatei.

Wie das ganze im Detail funktioniert bitte im Forum suchen oder Tutorials ansehen.